火焰鸟、闪电鸟、急冻鸟以及超梦是玩家可以稳定遭遇并尝试捕捉的几只核心传说宝可梦。火焰鸟位于1号岛屿的灯火山山顶，玩家在完成特定剧情获得船票后便可前往挑战。闪电鸟栖息在无人发电厂的内部最深处，需要玩家进入这座设施并进行探索。急冻鸟则藏在双子岛的洞穴深处，到达那里需要先完成一个推石头的解谜步骤来堵住瀑布水流。而实力最为强大的超梦，则静待在华蓝洞窟的最底层，前往该处需要掌握冲浪与攀瀑等秘传技能。
除了上述四只宝可梦，游戏内还存在其他一些可供捕捉的稀有传说宝可梦，但它们的出现方式或条件有所不同。梦幻的遭遇需要玩家先获得名为古代海图的特殊船票道具，之后才能在一座特定的小岛房屋中与之相遇。而洛奇亚与凤凰则位于第八座彩虹岛的不同方位，洛奇亚在岛屿的右下方，凤凰则在左上方，它们的等级通常较高，捕捉具备一定挑战性。炎帝、水君和雷公这三只传说中的宝可梦，在普通版本中并非固定地点出现，它们会在关东地区的特定草丛中随机游走，遭遇需要一定的耐心和运气。
成功捕捉这些神兽需要充分的准备和正确的策略。在遭遇目标前，建议将它们的血量削减至红色危险状态，并尽可能为其附加睡眠或冰冻等异常状态，这可以显著提高精灵球的捕获成功率。针对不同属性的神兽，组建具有属性克制优势的队伍尤为重要，例如使用水系或岩石系宝可梦对抗火焰鸟，利用地面系技能应对闪电鸟的电系招式。
探索这些神兽所在地点本身也是一项挑战，许多区域涉及迷宫和解谜。前往双子岛寻找急冻鸟时，需要将洞内的岩石推入指定位置以改变水流；而进入华蓝洞窟深处则要求玩家熟练运用多种秘传技能来穿越复杂地形。在动身之前，确保队伍中至少有一只宝可梦掌握了居合斩、怪力、闪光、冲浪、攀瀑等关键技能，以应对旅途中的各种障碍。
部分神兽的捕捉机会与游戏进程紧密相关。在完成主线剧情、击败关都地区的四天王并成为冠军之后，玩家才能获得前往七之岛等扩展区域的船票，从而解锁火焰鸟、洛奇亚等更多传说宝可梦的所在地。整个搜寻和捕捉过程贯穿游戏始终，建议玩家在冒险途中随时保存进度，并在完成每一次重要的捕捉或挑战后及时存档，以保障游戏成果。
